Atua na vigilância das Zoonoses, sendo estas qualquer infecção ou doença infecciosa transmissível, sob condições naturais, de homens a animais e vice-versa. Dentro da vigilância dessas doenças, também há a vigilância ambiental em saúde que se configura como um conjunto de ações que proporcionam o conhecimento e a detecção de qualquer mudança nos fatores determinantes e condicionantes do meio ambiente que interferem na saúde humana, com a finalidade de recomendar e adotar as medidas de prevenção e controle dos fatores de riscos e das doenças ou agravos relacionados à variável ambiental.Os programas de vigilância de zoonoses existentes na GEZOO, incluem: Angiostrongilíase, Acidentes com animais peçonhentos; Brucelose Chickungunya Dengue Doença de Chagas ESquistossomose Febre Maculosa Febre Amarela Filariose Hantavirose Leishmaniose Visceral Humana Leishmaniose Visceral Canina Leishmaniose Tegumentar Americana Leptospirose Malária Raiva Teníase/Cisticercose Toxoplasmose
Possui também o Laboratorio de Entomologia que presta suporte às investigações ambientais, capacitações específicas, pesquisa entomológica (identificação de vetores de importância epidemiológica, captura de roedores silvestres, bloqueios vacinais em cães e gatos,supervisões de campo.